Несколько мускульных пучков соединяют головогрудь с  брюшком. В стебельке, рядом с кишечником, проходит пара продольных мускулов, которые спереди начинаются в головогруди от эндостернита, а сзади прикрепляются к спинным мускулам первого сегмента брюшка. Более тонкие парные мускульные тяжи тянутся на вентральной стороне стебелька, прикрепляясь сзади к аподемам VII сегмента. Кроме того, в стебельке имеются две пары дорсовентраленых мышц.

В брюшке, непосредственно под мягкими покровами, прикрепляясь к ним во многих местах, лежит сетчатый слой мускульных волокон). Будучи развит весьма неодинаково в разных семействах, он обычно образует рыхлый мускульный мешок, окружающий внутренности (аналогично кожно-мускульному мешку червей).

Его сокращения, вероятно, имеют важное значение для циркуляции крови в брюшке и способствуют выдавливанию пищевых масс из долек печени. От висцеральной массы он отделен щелевидным просветом кровеносного синуса.

Но совершенно особый интерес представляет сохраняющая еще метамерный характер глубже лежащая мускулатура брюшка, строение которой чрезвычайно важно для понимания архитектоники этого отдела тела.

Наиболее примитивное состояние брюшной мускулатуры свойственно Liphistiidae с их хорошо расчлененным брюшком. У этих пауков эндотергиты и медиальные эндостерниты четырех передних сегментов брюшка (VIII—XI туловищных сегментов) соединены дорсовентральными мускулами.), располагающимися, следовательно, интерсегментарно.

Эндотергиты связаны друг с другом слабыми парными продольными дорсальными мышцами, которые в задних сегментах сближаются. На брюшной стороне продольные вентральные мышцы соответственным образом соединяют эндостерниты соседних сегментов, образуя четыре продольных ряда: два медиальных и два латеральных.

Кроме того, эндостерниты каждого сегмента соединяются вентральными поперечными мускульными пучками, за исключением медиальных эндостернитов четырех передних сегментов, которые связаны сухожильными тяжами.